上古時代
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拉古薩最初由古羅馬人興建。
12至19世紀
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杜布羅夫尼克改由兩個小聚落所組成的，一個在石上興建，在拉丁語中稱為Laus的地方，位於現址的南方；它曾經收容從Epidaurum而來的希臘及拉丁裔難民；另外一個則稱為Dubrava，是一個斯拉夫人的聚居地，位於Srđ山麓。
在兩城鎮之間，原本是一片濕地，在12世紀之中則被填平，把兩城鎮連在一起，成為兩鎮之間的廣場（今稱為Placa或Stradun）。該廣場則在1468年正式鋪設，並在1667年地震後重建。這城市有城牆保護，其兩個港口則建在地峽的兩端。
從第7世紀開始，該市受到拜占庭帝國的保護。在十字軍東征後，它則成為威尼斯的屬地；在1358年的Zadar和約後，它成為匈牙利王國的一部份。雖然經過很多勢力的統治、但這裡一直被當作交易港來使用。
在14世紀開始直至1808年，杜布羅夫尼克成為一自由邦，稱為「拉古薩共和國」（拉丁語為 Respublica Ragusina，又稱為杜布羅夫尼克共和國）。該國的國力在15至16世紀時達致高峯，當時它的國力可以與威尼斯及其他意大利海岸國家匹敵。
杜布羅夫尼克早在1272年已經擁有自己的法典，與當時其他的法典相近，包括羅馬的慣律及當地的傳統。那法典也包括城市規劃及傳染病隔離的準則。與其他鄰近地區比較，杜布羅夫尼克的法制及規劃是相對先進的，其中以下的例子最為突出：
- 在1301年引入醫療服務
- 在1317年已有第一所的藥房，至今仍如常運作
- 在1347年開設老人收容所
- 在1377年開設傳染病隔離醫院（拉丁語為Lazarete）
- 在1418年廢除奴隸貿易
- 在1432年開設孤兒院
- 在1436年建设20公里長的供水系統
杜布羅夫尼克是由貴族統治，統治機構為兩市的議會（Vijeće）。這樣的統治維持森嚴階級制度，可它也廢除奴隸制及高度尊重自由的。這城市更在威尼斯及鄂圖曼帝國的覬覦下仍然能維持其獨立的狀態。
拉古薩共和國的經濟實力，是由她所發展的地，以及更主要的海外貿易來鞏固的。
杜布羅夫尼克於18-19世紀後属於奧地利帝國及奧匈帝國。
1900年以後
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第二次世界大戰
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1941年4月南斯拉夫被德國、義大利、匈牙利及保加利亞等軸心國佔領肢解，杜布羅夫尼克劃為納粹德國及義大利王國的傀儡政權克羅地亞獨立國一部份，而杜布羅夫尼克亦為義大利在達尔馬提亞的勢力範圍之內。
南斯拉夫內戰
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主条目：南斯拉夫內戰、杜布羅夫尼克圍城戰和杜布罗夫尼克共和国
杜布羅夫尼克在1991至1992年被轟炸及遭破壞的地方
杜布羅夫尼克原是克羅地亞社會主義共和國的一部分，在1990年各南斯拉夫的社會主義共和國宣告獨立，而克羅地亞社會主義共和國也更名為克羅地亞共和國。
杜布羅夫尼克古城區在1970年代裁減武備，目的是防止它再受到戰火的偒害。但在1991年，克羅地亞共和國宣佈獨立後，在塞爾維亞的殘餘部隊南斯拉夫人民軍對該市發動进攻。
在1991年10月1日，杜布羅夫尼克受到南斯拉夫人民军的圍困，並持續七個月之久；15日，在南斯拉夫人民军的扶植下，杜布罗夫尼克共和国成立。在12月6日受到最嚴重的砲擊，有19人死亡及60人受傷。在圍城一役中，共有死者114人，包括著名詩人Milan Milisić。在1992年5月，克羅地亞軍夺取該城及其周邊地区，但南斯拉夫人民军在此后的3年里还有零星的襲擊。
在戰爭結束後，飽受砲轟的古城區依據聯合國教育、科學及文化組織的指引去修復。而在城門則有一個有關其受損程度的圖表；而在這次攻擊中的JNA軍官及將士皆成為前南斯拉夫戰犯之列。
在聯合國事務專員的最終專家報告中有述：
——"Due to the ideal observation capacity that the JNA enjoyed through its command of the high ground, the air, and the sea, it seems clear that (at best) the JNA was indifferent to the civilian casualties it caused or (at worst) it deliberately and systematically targeted civilians and civilian objects throughout this period."
中譯：
——「鑑於JNA在海陸空三方的肆意攻擊，結論為JNA明顯地罔顧市民的性命安危，也不排除JNA在該段時間故意及有系統地攻擊市民及民間的財產的可能性」